تحقیقات انجام شده درباره بررسی فنوتیپی و ژنوتیپی همولیزین های استافیلوکوکوس های جداشده از ... |
نمونههای استافیلوکوکوس که از عفونتهای بالینی جداسازی شده باشند، باید به روشهای رقیق سازی در آبگوشت و یا انتشار از دیسک مورد بررسی قرار بگیرند. مقاومت در برابر پنی سیلین G بر اساس مثبت بودن تست بتالاکتاماز قابل پیش بینی خواهد بود؛ تقریبا ۹۰% از سویههای استافیلوکوکوس اورئوس، آنزیم بتالاکتاماز را تولید می کنند. مقاومت در برابر نافسیلین (اگزاسیلین و متی سیلین)، در حدود ۳۵% از نمونههای استافیلوکوکوس اورئوس و تقریبا در ۷۵% از نمونههای استافیلوکوکوس اپیدرمیدیس، دیده می شود. مقاومت در برابر نافسیلین با حضور ژن mecA ارتباط دارد. این ژن یک پروتئین متصل شونده به پنی سیلین (PBP2a[29]) را کد می کند که نافسیلین روی این ژن تاثیری ندارد. ژن mecA در روش واکنش زنجیرهای پلیمراز قابل شناسایی است. اغلب آزمایشگاههای بالینی از یک روش فنوتیپی از قبیل کشت در محیط آگار غربال کننده اگزاسیلین، استفاده می کنند. استافیلوکوکوسهایی که در آگار مولر- هینتون حاوی ۴% نمک و g/mlμ۶ اگزاسیلین رشد کرده باشند، به طور شاخص از نظر mecA مثبت بوده و مقاوم به نافسیلین هستند. به گونه ای جایگزین، روشی برای سنجش محصول ژن mecA، پروتئین PBP2a در شکل تجارتی در دسترس است که نسبت به روش واکنش زنجیرهای پلیمراز برای ژن mecA و یا نسبت به آزمون بررسی مقاومت به روش کشت باکتری در محیط آگار نمک دار حاوی اگزاسیلین، بسیار سریع تر است (بروکس و همکاران، ۲۰۱۰).
۷-۱۵-۲- تستهای سرمی و تعیین تیپ:
تستهای سرمی که برای تشخیص عفونتهای حاصل از استافیلوکوکوس اورئوس، باشند ارزش کاربردی محدود دارند. روش تعیین تیپ مولکولی در ثابت کردن انتشار کلونهای اپیدمیک تولیدکننده بیماری-های حاصل از استافیلوکوکوس اورئوس مورد استفاده قرار گرفته اند. الکتروفورز ژل پالس- فیلد[۳۰] و تعیین تیپ سکانس مولتی لوکوس[۳۱]، قدرت تمایزدهندگی بالایی دارند (بروکس وهمکاران، ۲۰۱۰).
مواد و روشها
۱-۳- مواد و وسایل مورد نیاز:
الف) مواد مصرفی برای کشت استافیلوکوکوس
محیط آگار حاوی خون گوسفند
محیط آگار حاوی خون خرگوش
محیط آگار حاوی خون اسب
محیط مانیتول سالت آگار
محیط نوترینت آگار
محیط مولر - هینتون براث
محیط TSB[32]
پلاسمای خرگوش
ب) وسایل مصرفی برای استخراج DNA
سمپلر ۱۰۰۰ میکرولیتری
سمپلر ۱۰۰ میکرولیتری
سر سمپلر آبی، زرد و سفید
لوله اپندورف
ج) محلول های مصرفی برای استخراج DNA
محلول TE[33] (۱۰mM Tris-HCl , pH=8.1 mM EDTA)
محلول SDS[34] ۱۰ درصد(Roche, Germany)
پروتئیناز K (Fermentas, Germany, 20 mg/ml)
محلول NaCl 5 مولار (Merck)
محلول (CTAB[35]10 % ,NaCl 0.6 M) CTAB/NaCl
محلول فنل/ کلروفرم/ ایزو آمیل الکل (۲۵-۲۴-۱)، که این مواد به صورت یک حجم ایزو آمیل الکل، ۲۴ حجم کلروفرم و ۲۵ حجم فنل ترکیب شدند.
لیزوزیم (μg/ml 30)
ایزوپروپانول خالص (Merck)
اتانول ۷۰ درصد سرد
د) مواد مصرفی برای انجام واکنش زنجیرهای پلیمراز
dNTPs(Mμ۵۰، سیناژن)
(۷۵mM Tris-HCl, pH 9.0, 2mM MgCl2, 50mM KCl, 20mM [NH4]2SO4) PCRbuffer
Taq DNA Polymeras (سیناژن)
MgCl2 (سیناژن)
پرایمر R (سیناژن)
پرایمر F (سیناژن)
آب مقطر غیر یونیزه (مخصوص واکنش زنجیرهای پلیمراز )
ﻫ) مواد مصرفی برای الکتروفورز
ژل آگارز (Agarose, Merck, Germany)
اتیدیوم بروماید۱۰mg/ml
مارکر (Gene Ruler TM 100 bp DNA Ladder SMO331 & Fermentas, Germany)
بافر بارگذار[۳۶] (۶X Loading solution GBX8 & Fermentas, Germany)
Merck, Germany) 10X TAE[37] Buffer)
۱X TAE
و) دستگاههای مورد استفاده
دستگاه واکنش زنجیرهای پلیمراز (Bio - RAD)
دستگاه UV ترانس ایلومیناتور(BTS-20, Japan)
دستگاه الکتروفورز (Paya pajoohesh pars, Iran)
فرم در حال بارگذاری ...
[جمعه 1400-07-30] [ 07:06:00 ب.ظ ]
|